Oddělení dentoalveolární chirurgie se zabývá diagnostikou a chirurgickou léčbou závažnějších chorob a poranění v oblasti ústní dutiny i obličeje. Soustřeďují se zde pacienti s chorobami a komplikacemi vyvolanými přítomností dlouhodobě neošetřených zubů, zubů moudrosti, s úrazy zubních tkání, čelistních kostí i měkkých tkání, postižením mízních uzlin, a nádorovými chorobami. V řadě případů oddělení spolupracuje s oddělením ústní, čelistní a obličejové chirurgie a oddělením orální medicíny.
Oddělení má dlouholetou tradici v péči o celkově nemocné jedince. Spektrum celkových chorob, které mohou komplikovat stomatochirurgické ošetření, je velmi široké, a všichni tito pacienti vyžadují při provádění stomatochirurgických zákroků specifické způsoby ošetření. V řadě případů je proto nezbytná úzká spolupráce se specialisty z jiných lékařských oborů.
V rámci oddělení dentoalveolární chirurgie působí také specializovaná poradna pro léčbu nemocí čelistního kloubu a poradna pro maxilofaciální chirurgii. Oddělení je personálne a prostorově spjato s oddělením ústní, čelistní a obličejové chirurgie.