Oddělení je svým zaměřením na dětské pacienty do velké míry odborně spojeno s Pedostomatologickým oddělením.
Ortodontické oddělení se zabývá diagnostikou a léčbou nejrůznějších anomálií a poruch růstu čelistních kostí a postavení zubů. Klasickou klientelu tvoří dětští pacienti, v současnosti však nejsou vzácností ani dospělí pacienti vyžadující z nejrůznějších důvodů obdobnou péči (v dospělosti nehrazenou zdravotními pojišťovnami). Oddělení zajišťuje kromě pregraduální výuky studentů také postgraduální specializovanou výchovu zubních lékařů – ortodontistů.