CORE FACILITIES
Vznik CORE FACILITIES pro zlepšení kvality výzkumu spojeného s výukou na LF UK v HK
Univerzita Karlova, Lékařská fakulta v Hradci Králové je příjemcem dotace v rámci Operačního programu Výzkum, vývoj a vzdělávání (OP VVV), výzvy č. 02_16_017 Výzkumné infrastruktury pro vzdělávací účely - budování či modernizace v prioritní ose 1 OP, pro projekt Vznik CORE FACILITIES pro zlepšení kvality výzkumu spojeného s výukou na LF UK v HK vedeného pod registračním číslem CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_017/0002515.
Cíl projektu
Realizací projektu dojde ke zlepšení kvality výzkumu spojeného s výukou na LF UK v HK pořízením core facilities a dalšího materiálně technického a infrastrukturního zabezpečení nezbytného pro modernizaci doktorských studijních programů, která bude provedena v rámci komplementárního projektu INODOK. Projekt podpoří odborný růst studentů DSP a akademických pracovníků vč. postdoků a umožní jim získat nejen teoretické znalosti, ale i praktické dovednosti v moderních metodikách biomedicínského VaV.
Specifické cíle
-
Pořízení tzv. core facilities.
-
Podpora odborného růstu studentů DSP a vědeckých či klinických pracovníků v oblasti biomedicínského výzkumu, včetně osvojení praktických metodik a dovedností a využití mezioborové, příp. mezifakultní spolupráce.
-
Systematická podpora vědeckých aktivit akademických pracovníků a studentů v rámci programů DSP a SVOČ.
-
Podpora při zavádění vhodných metodických přístupů pro výše zmíněné vzdělávání.
Dotace
Dle Rozhodnutí o poskytnutí dotace jsou celkové způsobilé výdaje projektu ve výši:
192 699 824,53 Kč, z toho 163 794 850,85 Kč (85 %) z Evropského fondu pro regionální rozvoj, 19 269 982,45 Kč (10 %) ze státního rozpočtu ČR a 9 634 991,23 Kč (5 %) z vlastních zdrojů.
Harmonogram
|
Zahájení projektu: |
1. 1. 2016 |
|
Zahájení fyzické realizace projektu: |
1. 5. 2017 |
|
Vydání Rozhodnutí o poskytnutí dotace: |
31. 7. 2017 |
|
Ukončení fyzické realizace projektu: |
31. 7. 2021 |
|
Konec udržitelnosti projektu: |
14. 3. 2027 |
Projektový tým
|
ředitel projektu: | |
|
manažer projektu: |
Mgr. Petra Kubizňáková (01/2016-06/2019) Mgr. Eva Šitancová (07/2019-07/2021) |
|
finanční manažer: |
Ing. Lucie Radoňová, DiS. (06/2017-12/2017, 01/2021-07/2021) Ing. Lucie Sotonová (01/ 2018-12/2020) |
|
administrátor projektu: |
Kristýna Vaňková |
|
udržitelnost projektu: |
Pořízená infrastruktura pro výuku spojenou s výzkumem
Hmotnostní detektor (QQQ MS) a UHPLC systém
Xevo TQ-XS, ACQUITY UUPLC I-Class System (SM-FTN)
Přístroj je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 2:
-
úvodní přednáška: Základní principy analýzy exogenních a endogenních látek v biologickém materiálu;
-
navazující kurz: LC-MS hmotnostní spektrometrie.
Dodání: 18. 5. 2018
Umístění: Ústav lékařské biochemie
Veřejná zakázka na profilu zadavatele LFHKCF0005
Analyzátor buněk pro měření indikátorů mitochondriální respirace a glykolýzy
Agilent Seahorse XFe96 Analyzer Power Pak
Přístroj je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 3:
-
úvodní přednáška: Buněčné metody v biomedicínském výzkumu;
-
navazující kurz: Bioenergetika.
Dodání: 7. 6. 2018
Umístění: Ústav fyziologie
Veřejná zakázka na profilu zadavatele LFHKCF0020
Lightcycler RT-PCR
Přístroj je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 1:
-
úvodní přednáška: Molekulárně-biologické metody – genová exprese;
-
navazující kurz: Analýza nukleových kyselin qRT-PCR.
Dodání: 9. 8. 2018
Umístění: Ústav lékařské biologie a genetiky
Veřejná zakázka na profilu zadavatele LFHKCF0023
Ultrasound Imaging System, Vevo 3100
Ultrasound Imaging System, Vevo 3100
Přístroj je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 9:
-
úvodní přednáška: Metody práce s malými laboratorními zvířaty;
-
navazující kurz: Intravitální diagnostika laboratorních zvířat.
Dodání: 6. 9. 2018
Umístění: Vivárium
Veřejná zakázka na profilu zadavatele LFHKCF0004
IVIS Spectrum In Vivo Imaging System
IVIS Spectrum In Vivo Imaging System
Přístroj je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 9:
-
úvodní přednáška: Metody práce s malými laboratorními zvířaty;
-
navazující kurz: Intravitální diagnostika laboratorních zvířat.
Dodání: 25. 10. 2018
Umístění: Vivárium
Veřejná zakázka na profilu zadavatele LFHKCF0003
Laboratoř Comet assay
Laboratoř Comet assay byla v rámci projektu vybavena těmito přístroji:
-
Epi-fluorescenční mikroskop B-500TiFL vč. CCD kamery a SW
-
Laminární box Bio II Advance 6 Telstar
-
Chlazená stolní centrifuga Rotina 380R
-
inkubátor CO2
-
termoblok
Soubor přístrojů je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 13:
-
úvodní přednáška: Hodnocení zdravotních rizik
-
navazující kurz: Testování genotoxicity
Dodání: 09/2018 - 03/2020
Umístění: Ústav preventivního lékařství
Veřejné zakázky na profilu zadavatele LFHKCF0022 LFHKCF0053
Laboratoř molekulární farmakologie a toxikologie
Laboratoř molekulární farmakologie a toxikologie byla v rámci projektu vybavena těmito přístroji:
-
Wes Systém - kapilární automatizovaná platforma pro separaci proteinů
-
FUSION SOLO 7S EDGE (chemidokumentační systém)
-
POWER BLOTTER SYSTÉM (dry blot)
-
Soubor vybavení pro nácvik Western blotu (set přístrojů)
-
Bioruptor pico
-
qPCR
-
HPLC systém
-
Multifunkční destičkový reader Spark
-
ProFlex™ PCR System
-
Inkubátor CO2
-
Autokláv
-
Kontejner na skladování buněk v dusíku
-
ThermoMixer C s příslušenstvím SmartBlock (3 kusy)
-
Laminární box SafeFAST Classic 215
-
Úprava vody ultrapure Synergy UV
-
Analytické váhy RADWAG AS 220.3Y
-
Aspirační systém Fisherbrand Advantage
-
VetScan VS2
-
Chlazená stolní centrifuga s rotory Rotina 420R
-
Centrifuga chlazená 5424R G s rotorem (3 ks)
-
Aspirátor
-
pH metr
Soubor přístrojů je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloků:
-
blok 1 úvodní přednáška: Molekulárně-biologické metody – genová exprese
-
navazující kurz: Analýza nukleových kyselin – qRT-PCR
-
navazující kurz: Western blot
-
-
blok 11 úvodní přednáška: Principy hodnocení a modelování farmakokinetiky léčiv
-
navazující kurz: Metody analýzy farmakokinetiky léčiv
-
Dodání: 06/2018 - 05/2021
Umístění: Ústav farmakologie
Veřejné zakázky na profilu zadavatele LFHKCF0006 LFHKCF0007 LFHKCF0008 LFHKCF0022 LFHKCF0023 LFHKCF0024 LFHKCF0038 LFHKCF0053 LFHKCF0054 LFHKCF0057 LFHKCF0063
Laboratoř molekulárně mikrobiologických analýz
Laboratoř molekulárně mikrobiologických analýz byla v rámci projektu vybavena těmito přístroji:
-
Samag SM-12 (automatický izolátor nukleových kyselin)
-
Nanodrop
-
Real-Time PCR cyklér, Gradientový cyklér
-
GeneXpert systém
-
VeritiTM 96-Well Thermal Cycler
-
PCR box 2 ks
-
Gradientový real-time cyklér
-
Miseq sekvenátor
-
Kapilární sekvenátor
-
Vortex 3 ks
-
PowerPRO 300 (zdroj pro elektroforézu) 2 ks
-
Transiluminátor
-
Termoblok 2 ks
-
Analytické váhy RADWAG AS 82/220.R2
-
Laminární box SafeFAST Classic 215
-
Hlubokomrazicí box
-
Centrifuga 5425G s rotorem (2 ks)
-
Chlazená centrifuga 5425G s rotorem
-
Minicentrifuga 2 ks
-
Minivortex
-
Fotodokumentační systém
-
Elektroforetické vany
-
Chladící desky pro mikrozkumavky
Soubor přístrojů je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 8:
-
úvodní přednáška: Molekulární epidemiologie
-
navazující kurz: Identifikace a klasifikace původců infekcí - RFLP PCR, sekvenace
Dodání: 07/2018 - 06/2021
Umístění: Ústav klinické mikrobiologie, Ústav klinické biochemie a diagnostiky
Veřejné zakázky na profilu zadavatele LFHKCF0006 LFHKCF0009 LFHKCF0010 LFHKCF0011 LFHKCF0012 LFHKCF0019 LFHKCF0022 LFHKCF0052 LFHKCF0053 LFHKCF0060 LFHKCF0063
Laboratoř průtokové cytometrie
Laboratoř průtokové cytometrie byla v rámci projektu vybavena těmito přístroji:
-
UV-Vis spektrofotometr
-
Průtokový cytometr
-
Multifunkční destičkový reader Spark
-
Inkubátor CO2
-
Chlazená stolní centrifuga Rotina 420R
-
Centrifuga chlazená 5424R G s rotorem
-
xCelligence
Soubor přístrojů je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloků:
-
Blok 1 úvodní přednáška: Molekulárně-biologické metody – genová exprese
-
navazující kurz: Epigenetika
-
-
Blok 3 úvodní přednáška: Buněčné metody v biomedicínském výzkumu
-
navazující kurz: 3.1. Průtoková cytometrie
-
navazující kurz: 3.2. Způsoby kultivace buněk/Live cell monitoring
-
Dodání: 12/2018 - 05/2020
Umístění: Ústav lékařské biochemie
Veřejné zakázky na profilu zadavatele LFHKCF0008 LFHKCF0016 LFHKCF0019 LFHKCF0022 LFHKCF0053 LFHKCF0062
Elektrofyziologická laboratoř
Elektrofyziologická laboratoř byla v rámci projektu vybavena těmito přístroji:
-
Auto Refrakto-keratometr (ARK-1a)
-
HEP Perimetr
-
Eye Tracking, EyeLink 1000 Plus
-
Optická koherentní tomografie
Soubor přístrojů je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 12:
-
úvodní přednáška: Biofyzikální metody v biomedicínském výzkumu
-
navazující kurz: Neurovědní přístupy k hodnocení zrakového vnímání
Dodání: 08/2018 - 01/2021
Umístění: Ústav patologické fyziologie
Veřejné zakázky na profilu zadavatele LFHKCF0021 LFHKCF0043 LFHKCF0065
Vybavení a zařízení do Vivária
Vivárium bylo v rámci projektu vybaveno těmito položkami:
-
Individuálně ventilované klece pro hlodavce (96 ks) a ventilační jednotka k individuálně ventilovaným klecím pro hlodavce
-
Přestýlací a ochranný box
-
Ochranný box pro vysypávání podestýlky
-
Myčka klecí a pítek
-
Instrumentační vozík pro manipulaci s materiálem
-
Stojany na chovné nádoby
-
Inhalační anesteziologický přístroj pro malá zvířata (3 ks)
Dodání: 05/2019
Umístění: Vivárium
Veřejná zakázka na profilu zadavatele LFHKCF0018
Laboratoř ELISA
Laboratoř ELISA byla v rámci projektu vybavena těmito přístroji:
-
Hlubokomrazicí box
-
Chlazená centrifuga Universal 320R
-
Chlazená stolní centrifuga Universal 320R
-
Inkubátor
Soubor přístrojů je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 4:
-
úvodní přednáška: Imunologické diagnostické metody – současné možnosti
-
navazující kurz: Imunologické diagnostické metody
Dodání: 09/2019 - 05/2021
Umístění: Ústav klinické imunologie a alergologie
Veřejné zakázky na profilu zadavatele LFHKCF0052 LFHKCF0053 LFHKCF0063
Laboratoř molekulární patologie
Laboratoř molekulární patologie byla v rámci projektu vybavena těmito přístroji:
-
Barvící a montovací automat
-
Mikroskop s diskuzním zařízením
-
Laminární box
-
Izolátor DNA
-
PCR box
-
Vodní lázeň
-
Fluorescenční mikroskop
Soubor přístrojů je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 7:
-
úvodní přednáška: Pokročilé metody diagnostiky v patologii
-
navazující kurz: Molekulární morfologie
Dodání: 12/2019 - 03/2021
Umístění: Fingerlandův ústav patologie
Veřejné zakázky na profilu zadavatele LFHK0051 LFHK0058 LFHK0064
Laboratoř inteligentních materiálů v medicíně
Laboratoř inteligentních materiálů v medicíně byla v rámci projektu vybavena těmito přístroji:
-
Termokamera FLIR T1020-CP
-
3D tiskárna
Soubor přístrojů je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 12:
-
úvodní přednáška: Biofyzikální metody v biomedicínském výzkumu
-
navazující kurz: Analýza fyzikálních vlastností materiálů
Dodání: 02-07/2020
Umístění: Ústav lékařské biofyziky
Veřejné zakázky na profilu zadavatele LFHKCF0028 LFHKCF0029
Laboratoř elektronové mikroskopie
Laboratoř elektronové mikroskopie byla v rámci projektu vybavena těmito přístroji:
-
EDS analyzátor pro Elektronový transmisní mikroskop
-
Kryo attachment
-
Kryo ultramikrotom
-
Skenovací elektronový mikroskop
Soubor přístrojů je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 5:
-
úvodní přednáška: Elektronová mikroskopie
-
navazující kurz: Základy elektronové mikroskopie
Dodání: 11/2020 - 05/2021
Umístění: Ústav histologie a embryologie, Ústav anatomie
Veřejná zakázka na profilu zadavatele LFHKCF0014
Laboratoř experimentální gastroenterologie
Laboratoř experimentální gastroenterologie byla v rámci projektu vybavena těmito přístroji:
-
Kapslová endoskopie
-
Digitální cholangioskop
-
Zařízení pro vyšetření trávící trubice SmartPill
-
Endoskopická radiální a lineární ultrasonografie (včetně elastografie)
-
Abdominální ultrasonografie pro velká laboratorní zvířata
-
Dechové testy
-
High resolution jícnová manometrie ESO a AR 3D
-
Endocytoskopie
-
Videoendoskopická sestava
-
Anesteziologický přístroj pro velká laboratorní zvířata
Soubor přístrojů je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, vytvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 10:
-
úvodní přednáška: Experimentální gastroenterologie
-
navazující kurz: Experimentální gastroenterologie u prasat
Dodání: 12/2020 - 04/2021
Umístění: II. interní gastroenterologická klinika
Veřejná zakázka na profilu zadavatele LFHKCF0013
Výukové centrum patofyziologie v chirurgii
Výukové centrum patofyziologie v chirurgii byla v rámci projektu vybavena tímto přístrojem:
-
Monitor pro sledování tkáňové mikrocirkulace
Přístroj je navázaný na odbornou povinně volitelnou výuku předmětu Základy vědecké práce II, tvořenou v rámci projektu INODOK, a to bloku 9:
-
úvodní přednáška: Metody práce s laboratorními zvířaty
-
navazující kurz: Experimentální chirurgie
Dodání: 05/2021
Umístění: Vivárium
Veřejná zakázka na profilu zadavatele LFHKCF0017
