Počátky anatomického muzea jsou spojené se založením fakulty a ústavu v roce 1945. Exponáty a preparáty v muzeu přibývají po celou dobu jeho existence, je tedy dílem řady vyučujících, asistentů a studentů, kteří svou pečlivou prací umožňují nahlédnout návštěvníkům do tajemství lidského těla. Potřeba vytvoření muzea pramenila z touhy po ucelené výukové sbírce pro studenty medicíny, která by sloužila ke studiu lidské anatomie. Dnes je využívána nejen k výuce studentů medicíny, ale i k doplnění výuky somatologie na různých stupních a typech škol.

Vystavená sbírka představuje spektrum různorodých preparátů a kosterní exponáty, které jsou řazené dle systematické anatomie. Díky získání rozsáhlého kosterního souboru z kostnice při kostele sv. Petra a Pavla v Broumově disponuje muzeum rozsáhlou osteologickou sbírkou zahrnující dospělé i nedospělé kosterní ostatky. Tato sbírka čítá asi 1000 jedinců z období 13.-18.století a je základem pro pestrou sbírku vystavených kostních zajímavostí, anomálií a patologií. Z prostorových důvodů je v muzeu vystavena jen vybraná část exponátů. K náhledu do srovnávací anatomie pak slouží sbírka zvířecích koster a zajímavostí, od těch nejmenších hlodavců až po velké šelmy.

Muzeum je přístupné školám a odborné veřejnosti po předchozí domluvě. Upozorňujeme však na omezenou prostorovou kapacitu, muzeum se nachází přímo na chodbě Anatomického ústavu.